Sau khi hoàn thành nhiệm vụ, đặc vụ K lui về ở ẩn, vui thú điền viên. Còn đặc vụ J vẫn làm cho MIB và loay hoay đi tìm một cộng sự mới cho mình. Nhưng đặc vụ K sớm phải từ bỏ cuộc sống dân thường của mình để trở lại MIB khi Trái đất lại lâm nguy và ô...